Μία ασυνήθιστη εικόνα παρουσιάζει η λίμνη Πολυφύτου το τελευταίο διάστημα, λόγω της παρατεταμένης ξηρασίας, ως απόρροια της κλιματικής αλλαγής.

Σε ορισμένα σημεία έχει υποχωρήσει τόσο η στάθμη των νερών, ώστε ο βυθός να είναι ορατός και να διακρίνονται ακόμη και τα ψάρια. Στη γνωστή γέφυρα Ρυμνίου, το στολίδι της διαδρομής στην περιοχή, έχουν αποκαλυφθεί τα πέλματα στήριξης.

Σύμφωνα με ειδικούς, πάντα στο τέλος του καλοκαιριού τα αποθέματα μειώνονται, αλλά φέτος αυτό είναι περισσότερο από έντονο και αφορά τις περισσότερες λίμνες στην Ελλάδα.

Ένα επιπλέον ανησυχητικό φαινόμενο είναι τα νεκρά όστρακα στις όχθες της λίμνης, γεγονός που φαίνεται να οφείλεται στην υψηλή θερμοκρασία και την συνεπαγόμενη μείωση του οξυγόνου στο νερό.